Large projects of the Institute

The Instituto de Biciências (IB) acts intensly in several areas of research with the financing of several sources and national and international agencies. There are hundreds of research projects with those financings ongoing on IB. The projects listed below are only those with larger grants (R$300.000 and over):

 

CEPID

CEPID- Study Center for Human Genome/FAPESP 
Principal investigator: Profa. Mayana Zatz and also relies on the involvement of 6 other professors from this department.
http://genoma.ib.usp.br/?page_id=44

 

FINEP

Celular Therapy Center for Neurodegenerative, Neuromuscular and Craniofacial / Convenio Diseases-FINEP-USP, aiming at the production and research of adult stem cells for cell therapy
Principal investigator: Profa. Maria Rita Passos Bueno and the collaboration of 4 other professors from this department and UNIFESP researchers

 

INCTs

National Institute of Cience and Technology for Stem Cells in Human Genetic Diseases, INCT aims to estabilish a genetic disease stem cells bank. 
Principal investigator: Profa. Mayana Zatz, with the participation of 6 other professors from this department, 4 other investigators from laboratories in Vitoria (ES), Curitiba (PA), Belo Horizonte (MG) and 2 international researchers, making this an international theme.
http://www.fapesp.br/4849.html


National Institute of Cience and Technology (INCT) for Redox Processes in Biomedicine–Redoxoma (Prof. Luis E S Netto is a member of the manager committee).
2009-2014, National Institute of Biotecnology for Bioethanol
Principal investigator: Marcos Silveira Buckeridge.

 

NAPs

 

NUSCEP

Núcleo de Apoio à Pesquisa em Sinalização Celular na Interação Patógeno-Hospedeiro

Coordinator: Celia R. S. Garcia

 

Center for Research on Redox Processes in Biomedicine – Redoxoma (Pro-Rector Research Incentive Program – USP) 

Vice-coordinator: Prof. Luis E S Netto


Research Center for Marine Biodiversity (NP-BioMar). 
Principal investigator: Prof. Pio Colepicolo (IQ-USP) 
Profs. Antônio Carlos Marques e Mariana C. Oliveira are part of the managing team. Other professors from IB also integrate the NP-BioMar.
http://npbiomar.cebimar.usp.br


Research Center in Biodiversity and Computing 
Principal investigator: Antonio Mauro Saraiva
Participants: Profs. Astrid de M. P. Kleinert,  Isabel Alves dos Santos.

Research Center in Molecular Diversity of Natural Products 
Vice coordinator: Eny Iochevet Segal Floh  

 

FAPESP Themed

 

Functional Genomic of Plasmodium

Themed FAPESP - Project 11/51295-5 (2012-2017)

Coordinator: Celia R. S. Garcia

 

P. falciparum: Resistance molecular markers

Themed FAPESP - Process 09/53640-1( 2011-2014)

Coordinator: Celia R. S. Garcia

Biological aspects of thiols: protein structure, antioxidant defense, cell signaling and redox states
Principal investigator: Prof. Luis Eduardo Soares Netto, themed project (07/58147-6).
http://www.bv.fapesp.br/pt/projetos-tematicos/1914/aspectos-biologicos-tiois-estrutura-proteica/


Submicroscopic genomic imbalances associated with specific congenital abnormalities and mental deficiency phenotypes. 
Principal investigator: Profa. Carla Rosenberg (participant: Prof. Paulo Otto), themed project (processo 09/00898-1) 
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/5456/submicroscopic-genomic-imbalances-associated-specific/


Modularity and its evolutionary consequences. 
Principal investigator: Prof. Gabriel Henrique Marroig Zambonato, themed project FAPESP (processo 11/14295-7)
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/46489/modularity-its-evolutionary-consequences/


Diversity of red macroalgae (Rhodophyta) of São Paulo State, Brazil, based on barcoding, morphology and geographic distribution. (RHODO-SP). 2008-2013.
Principal investigator: Profa. Mariana Cabral de Oliveira, themed project FAPESP (07/51270-7)
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/1959/diversity-red-macroalgae-rhodophyta-sao/


Competence for Crassulacean Acid Metabolism (CAM) expression in epiphytic bromeliad: signaling, modulation of expression, transcriptional profile and interaction with the nitrogen metabolism. 2011 -2016.
Principal investigator: Profa. Helenice Mercier, FAPESP - 2011/50637-0 Research Aid - themed project
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/45489/competence-crassulacean-acid-metabolism-cam/


Sugarcane genome sequence: plant transposable elements are active contributors to gene structure variation, regulation and function. 2009 -2013
Principal investigator: Profa. Marie-Anne Van Sluys, FAPESP 2008/52074-0 Auxílio Pesquisa - Bioen Program - themed project
http://www.bv.fapesp.br/pt/projetos-tematicos/6490/sugarcane-genome-sequence-plant-transposable/


Mecanismos de ajuste do relógio biológico por luz e temperatura: aspectos filogenéticos. 2012-2016
Principal investigator: Profa. Ana Maria Castrucci, FAPESP Process: 12/50214-4
http://www.bv.fapesp.br/pt/projetos-tematicos/48018/mecanismos-ajuste-relogio-luz-temperatura/

Functional genomics in Plasmodium. 2007-2012 
Principal investigator: Profa. Celia Garcia, Fapesp Process 07/52924-0
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/1898/functional-genomics-plasmodium/.


P. falciparum: marcadores moleculares de resistência. 2011-201
Principal investigator: Profa. Celia Garcia, Fapesp Process 09/53640-1
http://www.bv.fapesp.br/pt/projetos-tematicos/29502/p-falciparum-marcadores-moleculares-resistencia/

Effects of global climate change of the Brazilian fauna: a conservation physiology approach. 
Principal investigator: Prof. Carlos Arturo Navas, themed project (PFPMCG/ PRONEX FAPESP)
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/6496/effects-global-climate-change-brazilian/

 

Other large projects

 

Research Project: Malaria melatonin receptor signaling as a novel drug target

NIH project 1R01AI099277-01

Co- Investigador: Célia R. S. Garcia

LANCE/ Agreement FINEP-USP, aims the research and development of embryonic stem cells.
Principal investigator: Profa. Lygia da Veiga Carramaschi and interaction with the Universidade Federal do Rio de Janeiro

Respostas Fisiológicas das Plantas às Mudanças Climáticas Globais, FUNDEPAG. 2006-2012
Principal investigator: Prof. Marcos Silveira Buckeridge

Expansão da coleção, renovação do material de montagem e digitalização dos acervos do herbário SPF, FAPESP  Programa Infra-estrutura 6 - M9 - Acervos Biológicos. 2011-2012
Principal investigator: Prof. Renato Mello-Silva

Rede Brasileira de Identificação Molecular de Organismos Marinhos, CNPq (564945/2010-2). 2010-2013
Principal investigator: Profa. Mariana Cabral de Oliveira
http://www.brbol.org/

 

Systematics of the tribe Bignonieae (Bignoniaceae), FAPESP 2011/50859-2. 2012-2014
Principal investigator: Profa. Lúcia Garcez Lohmann
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-regulares/54906/systematics-tribe-bignonieae-bignoniaceae/

Estudos de embriogênese em espécies arbóreas como estratégia para conservação de germoplasma e recuperação de ecossistemas ameaçados PETROBRAS
Principal investigator: Profa. Eny I.S. Floh

Centro de Estudos de Floresta Tropicais:  Dinâmica de Árvores na Amazônia e Floresta Atlântica de Restinga. 2008-2013
Principal investigator Prof. Alexandre Adalardo de Oliveira, Smithsonian Tropical Research Institute

Conservação e Restauração de Restingas do Estado de Sao Paulo. 2009-2013
Principal investigators: Prof. Alexandre Adalardo de Oliveira andProfa. Adriana Martini. Petrobras.

Structure and coevolutionary dynamics in mutualistic networks. FAPESP. 2011-2013
Principal investigator: Prof. Paulo Roberto Guimarães Junior
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-jovens-pesquisadores/7186/structure-coevolutionary-dynamics-mutualistic-networks/

Macroecology of sexual selection: large-scale influence of climate on sexually selected traits, FAPESP (process 2012/50229-1). 2012-2014
Principal investigator: Prof. Glauco Machado
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-regulares/48019/macroecology-sexual-selection-large-scale/

Desenvolvimento e aplicação de protocolos de análise de distribuições de abundância de espécies”, CNPq/FAPESP. 2011-2013
Principal investigator: Prof. Paulo Inácio Prado.

Origin and evolution of snakes and their diversification in the neotropics: a multidisciplinary approach. 2011-2016
Principal investigator: Prof. Márcio Martins. FAPESP Themed
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-tematicos/46143/origin-evolution-snakes-their-diversification/


The role of extinction and speciation rates, and the effect of different levels of biological organization on the origin and maintenance of biodiversity. 2012-2016
Principal investigator: Prof. Tiago B Quental. FAPESP (process 2012/04072-3)
http://www.bv.fapesp.br/en/projetos-jovens-pesquisadores/55145/role-extinction-speciation-rates-effect/


Inventário da Fauna de Characiformes (Teleostei, Ostariophysi) da América do Sul. 
Principal investigator: Prof. Dr. Naércio Aquino Menezes, with participation of Mônica Toledo-Piza Ragazzo. FAPESP (11/50282-7) 
http://www.bv.fapesp.br/pt/auxilios/35245/inventario-fauna-characiformes-teleostei-ostariophysi/


Respostas ecológicas e evolutivas à fragmentação da Mata Atlântica 
Principal investigator: Dr. Yuri L.R. Leite, Universidade Federal do Espírito Santo, with participation of Renata Pardini. PRONEX (processo 52274322)


Integrando níveis de organização em modelos ecológicos preditivos: aportes da epistemologia, modelagem e investigação empírica 
Principal investigator: Dr. Charbel El-Hani, Universidade Federal do Bahia, with participation of Renata Pardini. PRONEX (PNX 0016/2009)


Rede de Pesquisa Internacional: Rede Amazônia Sustentável 
Principal investigatores: Dra. Joice Ferreira (EMBRAPA), Dr. Toby Gardner (University of Cambridge), Dr. Jos Barlow (Lancaster University) e Dr. Luke Parry (Lancaster University), with participation of Renata Pardini. CNPq (574008/2008-0), Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – Embrapa (SEG: 02.08.06.005.00), the UK government Darwin Initiative (17-023), The Nature Conservancy, and Natural Environment Research Council (NERC) (NE/F01614X/1 and NE/G000816/1)


Núcleo de Apoio à Pesquisa em Inovação em Ensino de Ciências 
Principal investigator: Maurício Pietrocola (FEUSP), with participation of Profa. Alessandra Bizerra.


INCTTOX - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Toxinas, que visa o desenvolvimento de imunobiológicos e biofármacos no Brasil e ações em comunicação em ciência. 
Principal investigator: Osvaldo Augusto Sant'Anna (IBu)
Principal investigator of the Núcleo de Difusão: Profa. Alessandra Bizerra


Bentos em regiões portuárias ao longo da costa brasileira: biodiversidade, filogeografia e aspectos de bioinvasão por biofouling 
Principal investigator: Antonio C. Marques.


Estudos taxonômicos em grupos selecionados de invertebrados marinhos – uma perspectiva integrada 
Principal investigator: Antonio C. Marques. PROTAX MCT/CNPq/MEC/CAPES Nº 52/2010


Síntese e lacunas do conhecimento sobre organismos da zona costeiro-marinha brasileira 
Principal investigator: Antonio C. Marques. MCT/CNPq/MMA/MEC/CAPES/FNDCT – Ação Transversal/FAPs Nº 47/2010, processo 563106/2010-7 e FAPESP Auxílio Individual 2010/52324-6 
http://npbiomar.cebimar.usp.br/index.php/en/research/list_projects_details_npbiomar/90003


Dimensões da vida marinha – padrões e processos de diversificação em cnidários planctônicos e bentônicos 
Principal investigator: Antonio C. Marques. FAPESP themed – Biota program 2011/50242-5 
http://www.bv.fapesp.br/pt/auxilios/35242/dimensoes-vida-marinha-padroes-processos/


Núcleo de Pesquisa em Biodiversidade Marinha – NP-BioMar 
Principal investigator: Pio Colepicolo (IQ-USP)
Vice Principal investigator and coordinator of the preservation area: Antonio C. Marques
IB Participants: André Carrara Morandini, Carlos Eduardo Falavigna da Rocha, Fábio Lang da Silveira Fernando Portella de Luna Marques 
http://www.usp.br/prp/subpagina.php?menu=6&pagina=23&subpagina=78#


Estudos dos processos oceanográficos integrados da plataforma ao talude (INCT-PRO-OCEANO) 
Principal investigator: Ricardo Coutinho (IEAPM)
Principal investigator from USP and principal investigator of “3 -Taxonomia, Genética e Biogeografia do bentos da plataforma continental e talude da região Sudeste do Brasil”: Antonio C. Marques
IB Participants – André Carrara Morandini


Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais 
IB Participants: Yatiyo Yonenaga Yassuda. FAPESP 2011/50146-6 
http://www.bv.fapesp.br/pt/auxilios/35240/filogeografia-comparada-filogenia-modelagem-paleoclimatica/