PROGRAMAÇÃO

DIA

HORÁRIO

PROGRAMAÇÃO - primera semana

segunda-feira

27 de março

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: História da Sistemática. Aspectos filosóficos da Cladística.

TEXTO: HENNIG, W. 1965. Phylogenetic systematics. Ann. Rev. Ent., 10: 97-116.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: História da Sistemática. Aspectos filosóficos da Cladística.

TEXTO: FARRIS, J. S. 1983. The Logical Basis of Phylogenetic Analysis. In:  Platnick and Funk (eds), Advances in Cladistics. Proceeding of the second meeting of the Willi Hennig Society. Vol. 2 Columbia University Press, Ny.: 7-36.

terça-feira

28 de março

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Indução e dedução em sistemática.

TEXTOS: BROWER, A. V. Z. 2000. Evolution is not a necessary assumption of cladistic. Cladistcs 16: 143-154.

             KLUGE, A. G. 2001. Parsimony with and without Scientific justification. Cladistcs 17: 199-210.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: Tipos de parcimônia.

quarta-feira

29 de março

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Cenários evolutivos e padrões dicotômicos. História e conceitos de homologia. Jargões e conceitos cladísticos. Etapas de um estudo filogenético.

TEXTO: de PINNA, M.C. 1991. Concepts and tests of homology in the cladistic paradigm. Cladistics 7: 367-394.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: História da Sistemática. Aspectos filosóficos da Cladística.

PRÁTICA: NDE.

quinta-feira

30 de março

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Polarização e enraizamento.

TEXTOS: NIXON, K. C. and J. M. CARPENTER 1993. On outgroups.Cladistics 9: 413-426.

            BRYANT, H.N. 2001. Character polarity and the rooting of cladograms. In: Wagner, G.P. (ed.), The character concept in evolutionary biology. Academic Press, NY. Pp. 319-338.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: Consensos, ponderação, parcimônia e mensuração de topologias.

PRÁTICA: PAUP*.

sexta-feira

31 de março

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: 0timização de caracteres e buscas heurísticas.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: 0timização de caracteres e buscas heurísticas.

PRÁTICA: PAUP*.

DIA

HORÁRIO

PROGRAMAÇÃO - segunda semana

segunda-feira

24 de abril

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Novas tecnologias para conjuntos de dados de grande porte.

TEXTO: GOLOBOFF, P.A. 2001. Techniques for analysing large data sets. In: DeSalle, R., Giribet, G. & Wheeler, A. (eds.), Birkhauser Vrlag. Basel. Pp. 70-79.

Sugestões adicionais: GOLOBOFF, P.A. 1999. Analysing large data sets in reasonable time: solutions for composite optima. Cladistics 15: 415-428.

                                NIXON, K.C. 1999. The Parsimony Ratechet, a new method for rapid parsimony analysis. Cladistics 15: 177-182.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: Índices, poderação e dados lacunares (missing data).

TEXTO:  CARPENTER, J. M. (1994). "Successive weighting, reliability and evidence." Cladistics 10(2): 215-220.

WEINS, J. 2006. Missing data and the design of phylogenetic analysis. Journal of Biomedics Informatics. 39: 34-42.

PRÁTICA: TNT.

terça-feira

25 de abril

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Suporte.

TEXTOS: EGAN, J. 2006. Support versus corroboration. Journal of Biomedics Informatics. 39: 72-85.

             SIDDALL, M.E. 2001. Measures of support. In: DeSalle, R., Giribet, G. & Wheeler, A. (eds.), Birkhauser Vrlag. Basel. Pp. 70-79.

PRÁTICA: TNT.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: Alinhamento múltiplo e sensibilidade: Introdução.

PRÁTICA: LINUX, CLUSTALW & MALIGN98

quarta-feira

26 de abril

9:00 - 12:00 hrs

PRÁTICA: LINUX, CLUSTALW & MALIGN98

TEÓRICA: Alinhamento múltiplo: discussão dos tutoriais e textos.

TEXTO: GIRIBET, G. and W. C. Wheeler (1999). "On Gaps." Molecular Phylogenetics and Evolution 13(1): 132-149.

PHILLIPS, A., et al. (2000). "Multiple sequence alignment in phylogenetic analisis." Molecular Phylogenetics and Evolution 16(3): 317-330.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA: Introdução à otimização direta.

PRÁTICA: POY.

quinta-feira

27 de abril

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA: Conguência.

TEXTOS: AAGESEN et al. 2005. Sequence length variation, indel costs, and congruence in sensitivity analysis.Cladistics 21: 15-30.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA/PRÁTICA: POY.

sexta-feira

28 de abril

9:00 - 12:00 hrs

TEÓRICA/PRÁTICA: POY: Tutoriais avançados.

14:00 - 17:00 hrs

TEÓRICA/PRÁTICA: POY: Tutoriais avançados.